Dr. Hristo Ivanov: Droplet PCR urmărește cel mai precis pacienții cu cancer

Dr. Hristo Ivanov este medic de master. A absolvit MU – Plovdiv, în 2012. În 2016, a primit diploma științifică și educațională „Doctor în Genetică”. Din 2015 este asistent, iar din 2017 asistent șef la Catedra „Pediatrie și Genetică Medicală” din cadrul Universității de Medicină – Plovdiv.

Participă la o serie de proiecte științifice internaționale, precum KOPO – „How oncogenetics predicts and educates”, finanțate de Uniunea Europeană în cadrul programului Erasmus, precum și la un proiect al Centrului de competențe – „Personalized Innovative Medicine (PERIMED)”, legate de genetica medicală și medicina personalizată.

Dr. Ivanov are interese în neurogenetică, oncogenetică, farmacogenetică, genetică reproductivă și medicina de precizie. A urmat o serie de cursuri de certificare: nutrigenomică – testare genetică pentru nutriție personalizată la organizația Dietitians of Canada, lucrând cu o picătură digitală și cu un aparat PCR în timp real. Dr. Ivanov este membru al Societății Bulgare de Genetică și Genomică Umană.

În interviul cu dr. Hristo Ivanov, comentăm subiectul ultimelor inovații, prin care se poate urmări starea unei persoane diagnosticate cu cancer.

– Dr. Ivanov, ce este aparatul Emulsion Drop PCR?

– Aceasta este o tehnologie PCR de a treia generație care permite măsurarea absolut cantitativă a unei anumite molecule de acid nucleic, indiferent dacă este ARN sau ADN. Cea mai mare aplicare a acestei metode este în bolile oncologice, atunci când se caută cantitatea de moleculă de ADN mutantă pe baza fundalului alelei de tip sălbatic. Metoda este deosebit de potrivită pentru studiul ADN-ului tumoral, fără celule, la pacienții cu boli oncologice, deoarece unele dintre celelalte metode au un timp foarte dificil de a capta aceste molecule mutante în fondul de zgomot al ADN-ului normal, pe care îl numim cu termenul. „alelă de tip sălbatic”.

Este folosit ca o normă în genetică. Această metodă ne permite de fapt să captăm moleculele mutante de joasă frecvență pe fundalul normal.

– În ce direcție este îndreptată aplicarea acestei metode?

– Poate fi folosit pentru boli oncologice, in pretestele, la examinarea ADN-ului fetal liber celular. Aici vorbim din nou de unul celular liber, pe fondul ADN-ului matern. Deoarece scopul aici este de a diferenția cele două tipuri diferite de ADN. Poate fi folosit și în virologie, dar noi nu lucrăm în acest domeniu. În general, aceasta este o metodă mult mai sensibilă decât PCR normală în timp real.

– Ne puteți spune mai multe despre proiectul Perimed la care lucrați?

– Acesta este un proiect internațional de amploare, la care se lucrează, pe lângă universitatea noastră, și o parte din BAS și Universitatea din Plovdiv. Se numește „Perimed”, conform programului Centre de competență, și are legătură cu medicina personalizată. O parte a acestui proiect este de a crea protocoale de practică clinică care vizează urmărirea răspunsului la terapie și a bolii reziduale minime la pacienții cu cancer. Adică, dacă există încă o boală, precum și, în consecință, care este efectul terapiei prescrise.

Ideea este că, odată ce am identificat o mutație care inițiază cancerul, aceasta ar trebui să fie cuantificabilă și, în timp, dacă terapia dată funcționează, cantitatea de ADN mutant ar trebui să scadă. Dar dacă această cantitate nu scade, ci dimpotrivă – crește, înseamnă că terapia care se folosește în prezent nu dă niciun efect și cancerul continuă să crească și să elibereze o cantitate tot mai mare de ADN cu celule libere în sângele periferic. Dar acest proiect este încă la nivel de știință. Lucrăm la mai multe proiecte universitare interne și unul internațional care se concentrează pe cancerul de sân, plămâni și colon.

– Metoda poate fi folosită în viitor ca o bună practică de diagnosticare a bolilor oncologice?

– Da, aceasta este ideea proiectului, deoarece există anumite boli oncologice care sunt greu de accesat pentru biopsie și, de fapt, singura modalitate de a evalua așa-numitele peisajul genetic al tumorii, este atunci când ADN-ul celular este examinat liber. Când vorbim despre PCR, folosim această metodă pentru mutații deja cunoscute, adică trebuie să știm dinainte care este mutația care inițiază tumora pentru a putea măsura cantitativ.

Metoda pe care o folosim pentru a detecta mutația care inițiază tumora este secvențierea de generație următoare. În el, ADN-ul fără celule este de fapt secvențiat pentru a determina care este mutația inițială a procesului tumoral la acel pacient. De fapt, aceasta este o metodă de abordare personalizată – această mutație va fi tipică pentru un anumit pacient, dar nu va fi așa pentru toți ceilalți.

Dr. Hristo Ivanov

– Pentru diagnosticul ce tipuri de cancer este cea mai potrivită această metodă?

– Este potrivit pentru toate tipurile de cancer, dar cu avantaje deosebite pentru cele la care este mai dificil de luat o biopsie. Cancerul pulmonar este așa pentru că nu toate cazurile pot fi atinse cu o biopsie. Iar celălalt avantaj al metodei se referă la confortul pacientului însuși, pentru că una este să treacă prin întreaga procedură neplăcută asociată cu efectuarea unei biopsii și cu totul alta să i se ia pur și simplu sânge periferic.

– Ne puteți spune despre practica dumneavoastră clinică legată de mutațiile JAK2?

– Are ca scop evaluarea cantității de sarcină mutantă în mutațiile JAK2 asociate cu neoplaziile mieloproliferative negative Philadelphia. Acestea sunt policitemia vera, trombocitemia esențială și mielofibroza. Deoarece, în general, suntem unul dintre puținii, nu știu dacă nu singurii din Bulgaria, care pot determina cantitativ purtătorul mutațiilor JAK2.

– Studiul este acoperit de NHIF?

– Testarea mutațiilor JAK2 este acoperită în totalitate de NHIF. Cercetarea perimed este la nivel de știință și pacientul nu plătește pentru aceasta, iar dacă dorește să se implice în acest proiect, semnează un consimțământ informat că este dispus să participe la cercetare.

– Ce este farmacogenetica și cum este legată de tehnologia digitală PCR?

– Medicina personalizata merge mana in mana cu farmacogenetica. În funcție de ce polimorfisme, adică de ce modificări ai în ADN-ul tău, acesta determină dacă un medicament este potrivit pentru tine și în ce doză. Unele dintre medicamente sunt extrem de nepotrivite pentru persoanele care poartă anumite variații genetice.

Farmacogenetica este folosită în funcție de ceea ce cauți. Unele dintre cercetări sunt efectuate prin PCR, iar altele prin metoda de secvențiere. Metoda utilizată este determinată de dacă căutați o singură variantă la un anumit pacient sau mai multe variante diferite asociate cu mai multe medicamente diferite.

PSR digital nu este folosit doar pentru farmacogenetică, chiar aș spune că în acest scop mai degrabă aplicăm secvențierea și PSR în timp real atunci când căutăm dacă un pacient are sau nu o variantă anume, iar aici nu ne interesează cantitatea. a acelei variante. Motivul este că acestea sunt mutații ale liniei germinale, adică ne naștem și mergem cu ele, fiecare dintre celulele noastre purtând varianta corespunzătoare.

Farmacogenetica nu este utilizată numai pentru pacienții cu cancer. Este ceva care va intra probabil în practică în toate bolile. Multe dintre medicamente, în special în SUA, prescriu deja doza în funcție de genotipul pacientului care urmează să fie tratat cu acel medicament.

– Care sunt studiile genetice moleculare legate de genele de coagulare a sângelui ca prevenire a accidentelor vasculare?

– Acestea sunt studii de polimorfisme care sunt asociate cu un risc mai mare de accidente vasculare. Dacă, de exemplu, purtați un polimorfism în factor 2 sau 5, riscul unui incident vascular este de câteva ori mai mare decât cel al populației generale.

Aceste teste sunt utilizate și la unele femei însărcinate, deoarece unele dintre mutații sunt asociate cu un risc crescut de avort spontan. Ca și în cazul mutațiilor factorilor 2 și 5, dacă există, de asemenea, un istoric familial de accidente vasculare în familie – de la frați, mame și tați, sau există antecedente de accident vascular, Asociația Americană de Obstetrică și Ginecologie sugerează profilaxie cu -heparina cu greutate moleculara in timpul sarcinii in doze mici. Dar asta în cazurile în care există o mutație și un istoric al unui astfel de accident vascular.

– Și mutațiile pe care le-ați menționat sunt asociate cu ce tipuri de boli?

– Aceste mutatii sunt asociate cu evenimente vasculare precum embolia pulmonara. Există și studii care le leagă de bolile cardiovasculare, dar sunt un factor predispozant. Chiar dacă ai aceste mutații, nu înseamnă 100% că ți se va întâmpla ceva.

Delyana UZUNOVA

Rating
( No ratings yet )
Loading...
Știri și articole despre grădină și grădina de legume